农作物被水淹如果超过48小时，根部会发黄、发褐以致腐烂！另外，水淹过后会有一段虚弱期，这段时间农作物的抗病能力比较差，及时补救是非常主要的!
1、造成土壤中缺氧
如果土壤水分过多，时间过长，就会缺氧；当温度高时，破坏会加剧；轻则引起根系发育不良，重则引起种子腐烂、不出芽、根系腐烂、新苗(植株)大死；
2、造成根系功能降低
当蔬菜根系缺氧时，呼吸受到控制，根系的汲取能力大大降低；容易导致“生理饥饿”、“生理干旱”或植物倒伏；
3、发生有害养分
由于土壤长期缺氧缺水，厌氧微生物非常活跃，土壤中出现的有害养份(如硫化氢、乙烯、氨、甲烷等)会直接毒害根部；
4、造成土壤中肥料流失
肥料容易随着地面水的流出/渗入而流失，尤其是速效氮肥由于厌氧微生物的活性使氨或氮还原而流失；
5、晒死根系
由于流水或雨水的侵蚀，表层土壤流失加剧，根系暴露(翻根或暴露根)！天气晴朗后，在日光照射下，**的根系很容易死亡；
6、诱发病虫害
如果蔬菜长期处于洪水或高温高湿的环境中，容易被有害生物破坏，造成大面积病虫害，特别是细菌性病害；